Rooküla mõis (saksa k Rohküll) asutati 17. sajandi algul, mil ta eraldati Paunküla mõisa põhjapoolsetest maadest. 17. sajandil kuulus mõis nii Strassburgidele kui ka von Nasackinitele. 1755. aastal sai mõisa omanikuks Georg Meiners. 1816-57 kuulus mõis von Baumgartenitele, sealt alates aga Alexander von der Pahlenile. 1886. aastal omandas mõisa Lagedi mõisa omanik Rudolf von Ungern-Sternberg, millega Rooküla muutus faktiliselt Lagedi kõrvalmõisaks. Mõisa viimane võõrandamiseelne omanik oli Konstantin von Stackelberg, kelle käes oli mõis aastail 1913-19.

Mõisa peahoone oli arvatavasti 19. sajandi keskpaigas püstitatud võrdlemisi lihtsa välimusega ühekorruseline ehitis. Teise maailmasõja järgselt oli hoones metskond, kelle valduses ta 1968. aasta tulekahjus hävis. Mahapõlenud hoone asupaigale ehitati 1970tel aastatel puidust metskonnahoone, mis kaasajal on eravalduses. Mõisast on kaasajal alles peamiselt vaid väike park, ka kõrvalhooned on praktiliselt hävinud.

Ajaloolise jaotuse järgi Harjumaale Kose kihelkonda kuulunud mõis jääb kaasajal Harjumaale Anija valla territooriumile.